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六科
清初仿明制，设吏、户、礼、兵、刑、工六科，掌勘察官府公事。初为独立机构，至雍正元年（公元1723年）始隶都察院。六科的职官各有掌印给事中（满、汉各 1人），给事中（满、汉各 1人），笔帖式80人，经承63人。六科总数为167 人。掌印给事中，雍正七年（公元1729年）定为五品，光绪三十二年（公元1906年）升为正四品。给事中，初为七品，雍正七年升为正五品。
六科的具体职掌是：
掌科抄：各科每日派给事中 1人赴内阁接收题本，按题本内容，抄给各有关衙门分别承办。另摘录两份，一份叫史书，供史官记注用；另一份叫录书，存储于科署，以备编纂用。
掌封驳：《光绪会典事例》卷1014载，顺治初年规定：“凡部院督抚本章，已经奉旨，如确有未便施行之处，许该科奏还执奏。如内阁票签批本错误，及部院督抚本内事理未协，并听驳正”。“封还”和“驳正”是六科的主要职掌，但六科官员出于对皇帝及权臣的畏惧，为保住自己的官爵，这一职掌事实上是很少执行的。
此外，六科还分稽各项庶政，并分别注销各有关衙门文卷（即考核各项案件是否限期办妥）。各种稽核分工是：吏科稽核人事，注销吏部、顺天府文卷；户科稽核财赋，注销户部文卷；礼科稽核典礼事务，注销礼部、宗人府、理藩院、太常寺、光禄寺、鸿胪寺、国子监、钦天监等衙门文卷；兵科稽核军政，注销兵部、銮仪卫、太仆寺等衙门文卷；刑科稽核刑名案件，注销刑部文卷；工科稽核工程，注销工部文卷。乾隆十四年（公元1749年）奏准，都察院本身由刑科稽察。
六科又负责颁发官员敕书，凡内阁给官员之敕书，均交由六科发给，任满再送科缴还内阁。文武官赴任文凭，分由吏、兵两科注写期限。考察文武官员的“京察”，大计册、各项奏销册、文武生童学册，也均由六科分别察核。秋审，朝审案件，各道题签后，由刑科复奏，经御批，而密封交刑部施行。朝审处决人犯，由刑科监视行刑。
光绪三十二年（公元1906年）裁撤六科名称，设给事中20人。
五城都察院
五城都察院是稽察京师地方治安的机构。清代把京城分为中、东、西、南、北五城。都察院分派御史巡城，并设有巡城御史的公署，称为“五城察院”，或称“五城”。各城都设有兵马司，每司又分为二坊。由五城御史督率管理。负责审理诉讼、缉捕盗贼等事。顺治元年（公元1644年），设兵马司指挥 1人（正六品），副指挥 2人（正七品），吏目 1人（未入流）。顺治三年（公元1646年），为防止各地来京官员“钻营嘱托”，“交通贿赂”，定“由五城御史督令司、坊官员时加访缉”①。十年（公元1653年）更定：“五城御史各率所属，办理地方之事，厘剔奸弊，整顿风俗”②。其具体职掌是：稽察京师十坊之境。十坊分隶情况是“中城分中西、中东二坊；东城分朝阳、崇南二坊；西城分关外、宣南二坊；南城分东南、东坊；北城分灵中、日南二坊。每城由副指挥、吏目分掌二坊。凡人命案件，由五城指挥相验。盗窃案件，由副指挥、吏目察看现场和审解。其余词讼案件，由指挥报巡城御史审断。杖罪以下案件，自行完结，徒罪以上，送刑部定案。
五城察院还“掌赈恤之政令”。五城共设有 6个栖流所，10个粥厂，10个粜米厂， 1个普济堂， 1个育婴堂等，作为赈恤流民的机构。康熙二十年（公元1681年）于五城地方设厂15处，由佥都御史督同五城御史给满、汉军民人等发帑金，并令太医院医官施药。二十一年改为东、西、南、北四厂。至四十年（公元1701年），每年均遵例赈民。雍正七年（公元1729年）设五城铺司巡检各 1人，管理街巷栅栏的启闭。乾隆元年（公元1736年）裁五城铺司巡检，由五城察院及步军统领酌派兵役专司街巷栅栏之启闭。
顺治十六年（公元1659年），五城各设公所，于每月朔望吉日，由御史、司坊官组织乡约（即地方官选择的耆老），宣讲皇帝诰诫官民的诏令（顺治颁布的“六谕民”、康熙颁布的上谕十六条、雍正的“圣谕广训”十六条），其目的是使民“共知向善”，“以敦风化”。实际上是要人民做驯服的工具。
六、掌工程事务的机构----工部
清沿明制，于天聪五年（公元1631年）设立工部。初设时以贝勒阿巴泰管部务，以下设满承政 2人，蒙、汉承政各 1人，管理全国工程事务。顺治元年（公元1644年），停贝勒总理部务，改设满、汉尚书，无定员，满、汉左右侍郎各 1人。顺治五年（公元1648年），定满、汉尚书各 1人。乾隆十年（公元1745年）以大学士兼理部务。自顺治至光绪初年，工部各官名额屡有增减。据《光绪会典事例》卷20所载，其尚书满、汉各 1人（均从一品）。左右侍郎满、汉各 1人（均正二品）。郎中满18人，蒙 1人，汉 5人。员外郎宗室 1人，满19人，蒙 1人，汉 4人。堂主事满 3人，汉军 1人。主事宗室 1人，满11人，蒙 1人，汉 8人。司库 4人，司匠 2人，库使31人（以上三职均为满员）。笔帖式宗室 1人，满85人，蒙 2人，汉军10人。缮本笔帖式10人（满员）。经承78人。总数共317 人。此外尚有额外郎中、员外郎、主事及七品小京官若干人。
工部的职掌据《光绪会典》卷58所载是：
掌天下造作之政令，与其经费，以赞上奠万民。凡土木兴建之制，器物利用之式，渠堰疏障之法，陵寝供亿之典，百司以达于部，尚书、侍郎率其属以定议，大事上之，小事则行，以饬邦事。
可见工部是主管全国的土木、水利、机械器物制造工程等事务。凡较大的工程如工价超过50两，料价超过200 两的，要奏报皇帝御批。工料银在一千两以上者，要请皇帝另简大臣督修。各项工程所用经费，分“定款”、“筹款”、“借款”、“摊款”四种。定款是指定动用的某种款项；筹款是动拨其他款项交商生息筹备应用的款项；借款是酌借某种款项，竣工后分期归还；摊款是民修工程，先由官垫经费，竣工后摊征归还。
工部内部机构可分为两部分，一部分是办理部务的四个清吏司；另一部分是处理本部机关行政事务的机构。
四个清吏司的职官职掌如下：
（一）营缮清吏司：设郎中 6人（满 4人，蒙、汉各 1人），员外郎 5人（满 4人，汉 1人），主事 5人（满 2人，蒙 1人，汉 2人），笔帖式若干人，经承11人。营缮司下分设都吏、营造、柜、砖木、杂、夫匠六科和案房、算房、火房等单位，分掌本司事务。本司具体负责估修、核销都城、宫苑、坛庙、衙署、府第、仓库、营房、京城八旗衙署，顺天贡院、刑部监狱等工程隶属机构有琉璃窑、皇木厂、木仓等。
（二）虞衡清吏司：设郎中 5人（满 4人，汉 1人）、员外郎 6人（宗室 1人，满 3人，蒙、汉各 1人）、主事 4人（满 3人、汉 1人）、笔帖式若干人，经承14人。司下设都吏、军器、窑冶、柜、杂五科和军器案房、军器算房、窑冶案房、窑冶算房、火房等单位，分掌本司事务。虞衡司掌制造、收发各种官用器物、核销各地军费、军需、军火开支，主管全国度量衡制及熔炼铸钱，采办铜、铅、硝磺等事。该司在名义上还主管山泽采捕（主要是东珠采集），但此事实际上是由内务府主管。隶属虞衡司的机构有：司库（负责收发毡、革、驼、椿、橛等）、军需库（负责收发旗纛、帐房）、硝磺库（负责收发硝磺）、铅子库（负责收发大小枪炮、铅子）、炮子库（负责收储废铁炮子）、官车处（负责管理官车以备工程运送料物）、措薪厂（负责收发苇席、竿、绳）。
（三）都水清吏司：设郎中 6人（满 5人，汉 1人）、员外郎 6人（满 5人、汉 1人）、主事 6人（满 4人，汉 2人）。笔帖式若干人，经承 9人。司下设都吏、河防、桥道、织造、柜、杂六科和算房、火房，分掌本司事务。都水司掌稽核、估销河道、海塘、江防、沟渠、水利、桥梁、道路工程经费；各省修造战船、渡船及其他各种船只并核销河防官兵俸饷；修制祭器、乐器；征收船、货税及一部分木税。隶属机构有皇差销算处（负责核销皇帝出巡时各地所用维修桥梁、道路等费用）；冰窑（负责收发藏冰）；彩绸库（负责收发制帛、诰轴、彩绸、驾衣、宝砂、棕丝、藤竹）。
（四）屯田清吏司：设郎中 5人（满 4人，汉 1人），员外郎 6人（满 5人、汉 1人）、 主事 5人（宗室 1人，满、汉各 2人）、笔帖式若干人，经承 8人。司下设都吏、准支、柜、杂、匠五科和案房、算房、火房，分办本司事务。屯田司掌陵寝修缮及核销经费、支领物料；主管四司工匠定额及钱粮等事；管理各地开采煤窑及供应官用薪炭。
工部内管理行政事务的机构有：
清档房：负责收藏档案、并主管工部满洲官员之升补差委之事。
汉档房：负责缮写满、汉题本及黄册事务。
黄档房：负责考核岁支款项与工需物料，各项工程所用经费及由内务府取用库储料物，随时记载，到冬至之月，会同内务府奏请钦派大臣查奏。
司务厅：负责签收外省各衙门文书，呈工部堂官阅后，编号登记，分发各司办理。此外，还负责工部各司处吏员工役之任用管理。
督催所：按期限督催工部四司所办之事，逐月将办过的文件送都察院工科、陕西道注销。
当月处：负责管理工部印信，并接收在京各衙门文书、分发各司办理。
饭银处：负责收支工部司员饭食银两。
光绪三十二年（公元1906年），清政(蟹)府在“筹备立宪”，改革官制时，将工部并入商部而改为农工商部。三十三年十二月，又决定：由农工商部接收工部原管之河工、水利、海塘、江防、沟渠、船政、矿物、陶冶、度量权衡等事务；由民政部接管各项土木工程事务；由陆军部接管军器、战船、军需等事务；由内务府、礼部分别接管有关内、外典礼及制办各种器物的事务；由度支接管全部工关税收事务①。至此，工部便撤销了。
七、掌理少数民族及外交事务的机关----理藩院
崇德元年（公元1636年），皇太极创立了主管少数民族事务的专门机构----“蒙古衙门”。崇德三年六月，改蒙古衙门为理藩院。《光绪会典事例》卷20记载，康熙曾追述当年设理藩院的用意说：“太宗文皇帝时，蒙古部落尽来归附，设立理藩院，专管外藩事务”。可见皇太极改“蒙古衙门”为理藩院，主要还是管理蒙族事务。随着清王朝统治范围的扩大，理藩院成为统管内、外蒙古、察哈尔、青海、西藏、新疆以及西南地区土司各少数民族事务的机关。同时还兼办部分与外国通商及外事交接事务。
理藩院的职官，初设承政1 人，左右参政各 1人，副理事官 8人，启心郎 1人。顺治元年（公元1644年）改承政为尚书，参政为侍郎，副理事官为员外郎，并增加了员外郎和启心郎的名额，添设了堂主事、司务、副使、笔帖式等官。顺治十六年（公元1659年），理藩院尚书、侍郎兼任礼部官衔，定为“礼部尚书衔掌理藩院事”，“礼部侍郎衔协理理藩院事”。十八年，清世祖认为理藩院管外藩事务，责任重大，附属于礼部不合适，便下谕此后理藩院不必兼礼部头衔，于是又改称理藩院尚书、理藩院侍郎。并规定理藩院“官制体统”与六部相同。理藩院尚书可参预议政之事。
理藩院共有旗籍、王会、典属、柔远、徕远、理刑六司，以及满档房、汉档房、蒙古房、司务厅、当月处、督催所、银库、饭银处、俸档房等机构。职官有：尚书 1人（满员，从一品），左、右侍郎各 1人（满员，从二品），额外蒙古侍郎 1人，以蒙古贝勒、贝子之贤能者任之（二品）。郎中12人（宗室 1人、满 3人、蒙 8人，均正五品），员外郎36人（宗室 1人，满10人、蒙25人，从五品），堂主事 6人（满2人、蒙 3人，汉 1人），校正汉文官汉 2人，司务 2人（满、蒙各 1人），各司主事10人（满 2人，蒙 8人），银库司官、司库、司使 5人（均为满员），笔帖式95人（满34人，蒙55人，汉 6人）。共设官172 人。此外还额设吏役147 人。
理藩院总的职掌如下：
第一、掌蒙、回诸藩部王公、土司等官员的封袭、年班、进贡、随围、宴赏、给俸等事，并派遣该院司员、笔帖式等到少数民族聚居地区管事，定期更换；
第二、办理满、蒙联姻事务。凡遇皇帝下嫁公主等事，由宗人府会同理藩院办理；
第三、管理喇叭事务，保护黄教（黄教为佛教的一派，是明永乐年间唐古特僧人宗喀巴所创）；
第四、管理蒙古各旗会盟、划界、驿道及商业贸易事；
第五、修订惩治少数民族的法律，参加审理刑名案件。理藩院驻各处司员，参加对该地区民族案件的判决。凡判遣罪以上者，均报理藩院会同刑部或三法司审定执行。
第六、掌管部分外交、通商事务。咸丰年间，成立总理各国事务衙门，理藩院则不再担负外事工作。
理藩院六个清吏司的官员配置和职掌如下：
（一）旗籍清吏司：设郎中 3人（满 1人、蒙 2人）、员外郎 4人（宗室 1人，满 1人，蒙 2人），主事满 1人，笔帖式15人（满 5人，蒙10人），经承 2人，帖写书吏 2人。掌管“内扎萨克”（即内蒙古所属，包括24个部落，49个旗）划定疆界、封爵、会盟、驿递、军旅等事，以及归化城土默特部和达呼尔三旗任免引见事。
（二）王会清吏司：设郎中 3人（满 1人、蒙 2人）、员外郎 5人（满 2人，蒙 3人），主事蒙 3人，笔帖式11人（满 3人，蒙 8人），经承 2人，帖写书吏 1人。掌颁发内扎萨克王公等的俸禄，办理朝贡、赏赐等事宜。
（三）典属清吏司：设郎中 2人（满、蒙各 1人），员外郎 8人（满 2人，蒙 6人），主事 2人（满、蒙各 1人）。笔帖式10人（满 4人，蒙 6人），经承 1人，帖写书吏 2人。分掌“外扎萨克”（包括外蒙古、青海蒙古、西套蒙古和新疆金山、天山之间各部，都属外扎萨克）划定边界、封爵会盟、军旅、驿递。管理蒙藏各地喇嘛之事以及察哈尔等处各族牧民，管理少数民族地区贸易及俄商来恰克图贸易等事。
（四）柔远清吏司：设郎中宗室1人，员外郎 7人（满 2人，蒙 5人），主事蒙 1人，笔帖式11人（满 2人，蒙 9人）、经承 1人。分掌外扎萨克及喇嘛俸禄、朝贡之事。
（五）徕远清吏司：设郎中蒙 1人，员外郎 5人（满 1人，蒙 4人），主事蒙 2人，笔帖式 8人（满 3人，蒙 5人）、经承 2人。据《光绪会典事例》卷20载，乾隆二十六年（公元1761年）诏谕：“理藩院五司内派出一司，专司回部事务，其酌拟司名，及应设官员数目，承办事宜，详悉定议具奏。”其后遵旨议定，并旗籍、柔远为一司，增设徕远司。分掌回部扎萨克及四川土司之政令，并掌回城卡伦外各部落的朝贡、给衔等事务。
（六）理刑清吏司：设郎中蒙 2人，员外郎 6人（满 2人、蒙 4人），主事蒙 1人，笔帖式 7人（满 2人，蒙 5人），经承 1人。分掌外藩各部的刑罚事件。
此外，理藩院尚有附属的内馆、外馆、俄罗斯馆及蒙古官学、唐古特学、托忒学等单位。
理藩院掌管的部分外交事务，到咸丰十年（公元1860年）以后，划归总理衙门管理。到光绪三十二年（公元1906年），改革官制，理藩院改为理藩部。
八、分掌论纂文史的机关----翰林院及有关机构
翰林院
清初置文馆于盛京，命儒臣翻译满汉书籍，并记注本朝得失。天聪十年（公元1636年），文馆改为内三院，其中包括后来设置的内阁与翰林院的职掌。顺治元年（公元1644年），沿明制置翰林院，为正三品衙门。二年又并入内三院，改称“内翰林国史院”，“内翰林秘书院”、“内翰林弘文院”，升为从二品衙门。十五年（公元1658年）七月，改内三院为内阁，又另设翰林院，设满、汉掌院学士各 1人，都兼礼部侍郎头衔。十八年（公元1661年），裁内阁、翰林院，又设内三院。至康熙九年（公元1670年），再改内三院为内阁，翰林院又成为一个独立的机构①。其长官仍为掌院学士，满、汉各 1人，仍兼礼部侍郎头衔。康熙年间，因纂修各种文史书籍，需要大量文学之士，所以翰林院的编制人员很多，据《皇朝词林典故》卷22《纂修史书》条所载，编修、检讨等几至二百人，庶吉士也有五、六十人。雍正以后，翰林院人员大为削减，多调充其他官职，或京内科道、吏部，或京外道、府、州、县。以后凡在翰林院任职满六年之编修、检讨，由院保送，以知府任用，成为定例。雍正八年（公元1730年），升掌院学士为从二品，从大学士、尚书中特选兼任。雍正曾说：“国家建官分职，于翰林之选，尤为慎重，必人品端方，学问纯粹，始为无忝厥职，所以培馆阁之才，储公辅之器。”②这说明翰林院为国家储才的机关。乾隆五十八年（公元1793年），定掌院学士不再兼礼部侍郎官衔。自此以后，翰林院就成为更重要的国家机关了。
翰林院官员名额，据《光绪会典》卷70的记载，有掌院学士满、汉各 1人，侍读学士、侍讲学士、侍读、侍讲，都是满 2人，汉 3人，修撰、编修、检讨均无定额。以下尚有待诏满、汉各 2人，笔帖式满40人，汉军 4人，典薄满、汉各 1人，孔目满、汉各 1人，五经博士27人，堂供事 4人，供事14人，总员额为119 人。这些官员的任用资格是：掌院学士由大学士、尚书、侍郎内简选。侍读学士、侍讲学士、侍读、侍讲等官，由各衙门应升之郎中等官文义优通者选任。修撰以“三鼎甲”（殿试前三名）中状元补授，编修以榜眼、探花补授。检讨则以“三甲”进士散馆补授。翰林院官员授职后，每隔几年再进行考试，称为“大考”。考后按成绩分为四等，一等特加重用，二等升阶；三、四等分别予以处分。
翰林院的职掌是：
（一）充经筵日讲：每年秋天举行经筵典礼，先由翰林院开列直讲官满、汉各 8人（满讲官由大学士以下，副都御史以上充任；汉讲官以翰林出身之大学士、尚书、侍郎、内阁学士、詹事、侍读学士、侍讲学士、国子监祭酒充任），奏请皇帝钦派四人值讲。
（二）掌进士“朝考”之事：清代科举制度，每科于“殿试传胪”后，礼部以新进士名册送翰林院，由掌院学士奏请“御试”于保和殿。
（三）论撰文史：其所撰有祝文、册宝文（册立、册封后妃）、册诰文（册封王公）、碑文、谕祭文等。此外，纂修实录、圣训、本纪、玉牒及其他书史，或由翰林院承办，或由翰林院派编修、检讨参与纂修。而对书史的编辑校勘，则是翰林院官的主要职务。
（四）稽查史书、录书：六科根据红本辑录的史书（送内阁），录书（存科），为防止“玩忽潦草”，每年派翰林官两人专司稽查。
（五）稽查官学功课：宗人府的宗学、觉罗学，内务府的咸安宫官学及八旗的官学，都派翰林官稽查教习功课。
（六）稽查理藩院档案：理藩院的档案关系重大，须随时整理，例由翰林院派翰林官稽查，以重其事。
（七）入值侍班：顺治十七年（公元1660年）谕，翰林各官，原系文学侍从之臣，分班值宿，以备顾问，并在景云门内建造值房，翰林官分班入值。康熙三十二年（公元1693年）定翰林官在尚书房侍值。道光八年（公元1828年）又定于圆明园值班。
（八）扈从：顺治九年（公元1652年），定皇帝巡幸京城内外及王府等处，翰林院例应派员随从。
（九）每遇直省文武乡试、会试、殿试时充主考官、读卷官；顺天乡试，掌院学士充正、副主考、侍读、侍讲以下担任考官。各省乡试，学士以下、编修、检讨以上都可以充任正副考官。会试，掌院学士充任正副考官，侍读、侍讲学士以下充同考官。武科会试，侍读、侍讲学士都可以充任正副考官。
（十）考选、教习庶吉士：开列教习庶吉士职名，从侍读、侍讲、修撰、编修、检讨中选择学问优异者担任小教习。
翰林院内部组织有典簿厅与待诏厅。
典簿厅掌奏章、文移及吏员、差役的管理事务，并保管图书。额设典簿满、汉各 1人，孔目满、汉各 1人，笔帖式若干人（满40人，汉军 4人，分在两厅办事）。
待诏厅：掌缮写、校勘之事，额设满、汉待诏各 2人，笔帖式若干人。满待诏掌校时，翻译章奏、文史；汉待诏掌校对，缮写所撰之史。
庶常馆
清初设庶常馆，隶内弘文院，为新进士深造之所，也是沿明制而设的。顺治三年（公元1646年）定制，每年殿试后，选德才兼优之士为庶吉士，再入馆学习，名为馆选。因庶吉士又称庶常吉士，故其学馆称为庶常馆。庶常馆设满、汉教习 2人，由吏部开列翰林院掌院学士、内阁学士，题请皇帝“钦派”。或于大学士、尚书、侍郎内特简。小教习若干人，由侍读学士以下各官内选用。分别训练庶吉士满、汉文课程。提调 2人，供事 1人。提调由掌院学士在编修、检讨内派充，掌庶常馆的行政事务。
庶吉士在馆学习三年，学习清文、翻译及汉文之经史、词、诗等。期满，由庶常馆教习奏请皇帝“御试”，分发任用，称为“散馆”。庶吉士在馆学习期间，每人每月给廪饩银四两五钱，到户部领取。器用什物，到工部支取。
起居注馆
起居注馆，是记录皇帝言行，编纂起居注的机构。顺治十二年（公元1655年）谕：“朕惟自古帝王，勤学图治，必举经筵日讲，以资启沃”①。选满、汉臣 8人，以原官衔充日讲官，每日为皇帝讲解经书，并规定每年二、八月春秋二季举行“经筵”之后，按日举行日讲。康熙七年（公元1668年），遴选儒臣，簪笔左右，记皇帝一言一动，“书之册简，以垂永久”。八年又选择满、汉词臣数人“备顾问记起居”。九年始设起居注馆，满汉记注官均以日讲官兼。日讲起居注官满10人、汉12人，除翰林院掌院学士、詹事府詹事照例兼充外，余由翰林院侍读学士以下、詹事府少詹事以下简充，掌记注之事。
记注体例，是将谕旨、题奏、官员引见、除授等依次记载。编纂记注每月分为 2册，每年计24册，先成草本，由总办记注官逐条查核增改，送掌院学士阅定，记明年月及记注官名，册中用翰林院印盖齐缝，然后封存铁柜。
詹事府
清沿明制，于顺治元年（1644年）设詹事府，为辅导东宫太子之机构，同年十一月裁撤，其事务并入内三院。顺治九年（公元1652年）复置，设詹事、少詹事，以内三院官兼任。康熙五十一年（公元1712年），废立皇太子后停止。乾隆十八年（公元1753年）谕：“詹事府东宫僚佐，储贰未建，其官原可不设，第以翰林叙进之阶，姑留以备词臣迁转地耳”①。自此以后，詹事府官员专备翰林院迁转之资。
詹事府设詹事满、汉各 1人（正三品）、少詹事满、汉各 1人（正四品），左、右庶子满、汉各 1人（正五品），洗马满、汉各 1人（从五品）、左、右中允满、汉各 1人（正六品），左、右赞善满、汉各 1人（从六品），主簿满、汉各 1人（从七品）、笔帖式 6人。
詹事府的职掌是：凡皇帝坐朝或秋审、朝审以及九卿、翰、科、道会议之事，詹事、少詹事均得“侍班”或参加集议。凡纂修实录、圣训，詹事府詹事、少詹事例得充任副总裁官及纂修官。纂修其他书史，少詹事皆得充任纂修官。此外，有些职掌是与翰林院互兼的。清初规定，凡东宫千秋节（东宫诞辰）及元旦、冬至行礼庆祝、表笺文式，由詹事府坊局官撰拟颁发。
詹事府内部机构分左右春坊、司经局及主簿厅，其职官及分掌如下：
左右春坊：设左、右庶子满、汉各 1人，左右中允满、汉各 1人，左右赞善满、汉各 1人，掌记注、纂修之事。其汉员，分别兼翰林院侍读、侍讲、编修、检讨等衔。
司经局：设洗马满、汉各 1人，掌经籍、典制、图书刊刻的收藏。其汉员兼翰林院修撰衔。初设汉正字 2人，掌缮写讲章及装潢之事。
主簿厅：设主簿满、汉各 1人，掌文移；笔帖式满 6人，掌翻译。
詹事府的机构掌章奏、文移事务，另设满、汉主簿 2人管理。
从詹事府的具体执掌看，已无本府的专职，实际上变成了翰林院的辅佐机构。所以光绪二十八年（公元1902年），改革官制，实行“新政”，便以詹事府名实不符，首先被裁撤，其事务归入翰林院。
清朝官制(中央首辅机构)
清代的中央首辅机构清初期，承袭未入关前的旧规，以满洲特有的旗制为其本部骨干，基本上按明代制度统治汉人。直到雍正、乾隆两朝，才逐步调整，得以比较稳定下来。
中央机构设置如下：
一、内阁
顺治十五年（公元1658年）七月，清王朝参照明制，改内三院为内阁。大学士改加殿、阁头衔，称“中和殿大学士”、“保和殿大学士”、“文华殿大学士”、“武英殿大学士”、“文渊阁大学士”、“东阁大学士”（乾隆十三年去掉中和殿，增入体仁阁，成为三殿三阁）。大学士的品级改为正五品，这也是参照明制，怕大学士权力过重，而特降低其品秩，借以抑制。这时的内阁，虽具有掌握最高政权的中枢机关的雏形，但因大学士降低了品秩，又减少了办事人员，所以其权任反较顺治初年之内三院为轻了。
内阁大学士的品级，到雍正八年（公元1730年），满、汉俱定为正一品。至此，大学士成为清王朝最高的官员，犹如历朝的丞相。《清史稿·大学士年表序》说：
清大学士满、汉两途，勋高位极，乃以相授……其品列皆首文班。任军机者，自亲王外，其领袖者必大学士，唐、元三公尚不及也。
这说明清代大学士的地位是极为尊崇的。
协办大学士，犹如宋之参知政事，为大学士之副职。初期未有定额设置，遇有大学士在内廷行走或奉差在外，才另选人员协办阁务。早在雍正元年至五年间（公元1723—1727）有署大学士，六年（公元1728年）又有额外大学士。十年至十三年（公元1732—1735年）再设协理大学士。到乾隆四年（公元1739年）才有协办大学士，以后并改为常设。其品级比大学士稍低，从一品。
内阁学士的品级为从二品，均兼侍郎衔（乾隆五十八年以后去兼衔）。其职掌是：满学士掌奏本章，汉学士掌批“题本”（内外官员汇报皇帝之文书）。若依其应有权任，并不仅于此。如康熙二十一年（公元1682年）谕：“学士乃参赞政事之官，如有所见，应行启奏。近来并无与议者，若惟送本接本，用一笔帖式足矣，何必设立学士？此后各有所见，俱令敷陈。”①虽有此谕，可是一般学士仍按步就班，作一些例行之事而已，远不如军机章京职责之重。
内阁人员的额数，据《大清会典》、《清史稿》等书的记载，规定为：大学士满、汉各 2人，协办大学士满、汉各一人，学士满 6人、汉 4人，典籍满、汉、汉军（编入八旗之汉人）各 2人，侍读学士满 4人，蒙、汉各 2人，侍讲满10人，蒙、汉、汉军各 2人，委署侍读无定员，中书满70人，蒙16人，汉30人，汉军 8人，帖写中书满40人，蒙古 6人（以上各员额时有增减），撰文中书无定员，供事62人，总人数为 288人（委署侍读是由典籍内派委、撰文中书是由中书内派委，都不占额数）。
内阁乃诸曹总汇之区。其职掌据《光绪会典》卷2 载：“掌议天下之政，宣布丝纶、厘治宪典，总钧衡之任，以赞上理庶务。凡大典礼，则率百寮以将事”。其具体的职务有：
第一，掌议政事，宣布纶音（皇帝的诏令）。
内阁为正一品衙门，位在六部之上。大学士“位尊望重”，其职务首先是议政事，宣布纶音。阁臣常在皇帝的左右，充当顾问。他们不但对答政事中的疑难问题，而且为皇帝办理公文，草拟谕旨。内阁所承办的公文有制、诏、诰、敕、题、奏、表、笺。据《光绪会典》卷2载：
凡纶音之下达者，曰制、曰诏、曰诰、曰敕，皆拟其式而进焉。凡大典宣示百寮，则有制辞。大政事、布告臣民，垂示彝宪，则有诏，有诰。覃恩封赠五品以上官，及世爵承袭罔替者，曰诰命。敕封外藩、覃恩封赠六品以下官，及世爵有袭次者，曰敕命。谕告外藩及外任官坐名敕、传敕，曰敕谕。
内阁为丝纶重地，每日钦奉上谕，由军机处承旨，凡应发钞者，皆下于内阁。此外，内阁还负责记载纶音，所载事项分为三册：凡每日发科本章，满汉票签处当直中书摘记事由、详录圣旨者分为一册，称为“丝纶簿”；特降谕旨者分为一册，称为“上谕簿”；中外臣工奏折，奉旨允行，及交部议覆者，分为一册，称为“外记簿”。三册存放内阁，以备参考。
第二，办理本章。
内阁的日常事务，是为皇帝办理本章。《内阁志》中说：“大学士于军国，事无不统，其实每日所治事，则阅本也。”《皇朝文献通考》卷80载，大学士的职务主要也是办理本章。清代内外官的本章可分为通本和部本两类。凡各省将军、督抚、提镇、学政、盐政、顺天府尹、盛京（今辽宁省）五部本章，俱通过通政司再送内阁，称为“通本”；在京六部及各院、府、寺、监衙门本章，称为“部本”。通本到阁后因无满文部分，先由汉本房将其贴黄翻译为满文，转满本房校阅，缮写清楚粘贴于后。部本原系满、汉文合璧，与译好的通本一并交汉票签处。由中书草拟票签，经侍读学士校阅，由大学士审阅后，交满、汉票签处缮写满、汉文正签。经内奏事处进呈御览；皇帝批阅后，交批本处，汉学士批汉字于正面，翰林满人中书批满字于反面，至此成为“红本”。接着是下达执行：由满本房领出交红本处，每日六科给事中来处承领，到科后抄发各衙门执行；每年终，由六科给事中回缴红本处，转交典籍北厅，再入红本库保存。此外，内阁还处理部分奏折。
第三，办理典礼祭祀的有关事宜。
凡是比较隆重的典礼和祭祀，如皇帝登极、立后、祭天(蟹)地、祖宗等，都由内阁办理。《光绪会典》卷2 载：
凡大祀、中祀，前期书祝版。奉神位于坛庙，则视镌与其饰青。制册宝亦如之。皇帝登极则奉诏，授受大典，奉宝亦如之。册立册封则授节。命将出师，授敕印亦如之。文武传胪则奉榜。凡大朝会、进表，则展表所宣焉。
第四，组织修书，存贮档籍。
纂修史籍，本是翰林院职掌。顺治初，以翰林院分隶内三院，修书各馆，也附设于内三院。康熙以后，虽分设翰林院，但各书修纂，仍以内阁大学士任监修总裁官，学士则分兼副总裁、总纂、纂修等职。此外，内阁还负责档案典籍保藏。在东华门内置红本、实录库，这是清政(蟹)府重要的档案库。另外还收存揭帖。《光绪会典事例》卷14载，“雍正七年（公元1729年）议准，各省题奏本章，俱增写揭帖一通，送起居注馆，俟记注后，将揭帖转送内阁收存。”内阁收存最大量的档案是红本，其他还保存实录、圣训。
内阁的内部设有典籍厅、满本房、汉本房、蒙古房、满票签处、汉票签处、诰敕房、稽察房、收发红本处、饭银处、副本库、批本处等机构，分掌各项事务，其设官员额及具体职掌分别如下：
典籍厅：是内阁的秘书部门，有学士10人（满 6人，汉 4人）、典籍6人（满、汉、汉军各 2人），供事22人。此外侍读学士、侍读、中书等兼在典籍厅办事者，由大学士派委，无定员。其办事之所，分南、北两厅。南厅职掌有四：
（一）掌关防。内阁无印，对外行文，用典籍厅关防。
（二）收发及办理文稿。各衙门来文，直送两厅，再按事务性质分送各房。
（三）官员考绩事务。负责对侍读、典籍、中书等官的考绩。
（四）管理“吏役”事务。考取助理事务的“供事”及管辖皂役等事。
北厅职掌也有四项：
（一）掌奏章。拟办陈事请旨之奏本及进贺表等。
（二）办理大典事务。即关于大典礼的筹备应办事项。
（三）用宝洗宝。请用国家宝玺及岁终封宝日洗宝事务。
（四）收藏红本图籍，并收贮表章等。
满本房，或称满本堂或满洲堂。有侍读学士 2人，侍读 4人，中书39人，贴写中书24人，供事 3人，共72人（均为满员）。掌校阅题本的满文部分，管理内阁大库及皇史宬的收藏事务。如收贮实录、圣训、起居注、史书、方略及经略将军的印信等物。收发和每日向皇帝进呈实录，增修王公世爵谱册以及缮写各项满洲文字。
汉本房，又名汉本堂，有侍读学士 4人（满、汉各 2人），侍读 5人（满 3人，汉 2人）、中书42人（满31人，汉军 8人，汉 3人），贴写中书16人（都是满员），供事 3人。其职掌为收发通本，翻写贴黄及各项应翻为满文之文书，如上谕、碑文、册宝、祝版应译为满文者均属之。故又有翻译房之称。
蒙古房，又称蒙古堂，有侍读学士 2人，侍读 2人，中书16人，贴写中书16人（以上均蒙员）。掌翻译蒙、回、藏等各种文字以及外国来文。凡遇有各藩部陈奏事件及表文，皆译出具奏。凡颂扬各藩部诰敕、碑文、匾额以及奉旨特交事件，俱由蒙古房译出缮写。并管理蒙古实录，圣训。凡外国文字，如俄国照会，即召翰林院俄罗斯馆官员至房翻译。西方各国来照，即召西洋馆官员翻译。
满票签处，有侍读 3人（满员），中书22人（满20人，蒙古 2人），贴写中书 8人（满员）、供事 4人，此外尚有委署侍读（满员）若干人。满票签处掌校阅满文本章并撰缮满文票签，皇帝出巡时，发递本报。京内外官员的奏折，经皇帝批阅，应交在京各衙门知道或办理的，由军机处交满票签处，传知各衙门钞回办理。
汉票签处，有侍读 2人，中书27人（以上均汉员），供事 4人。此外有委署侍读若干人。掌校阅汉文本章，撰缮汉文票签；撰拟御制文字，如制、诏、诰、敕、册文、祝文、封号等。
诰敕房，康熙十年（公元1671年）始设诰敕房，隶汉本房兼管。专司校勘和收发诰敕。凡汉票签处撰拟诰敕，由诰敕房审核，缮定正本，用宝颁发。封赠诰敕，按定式刊刻存储，凡用时交中书科填写，经诰敕房校阅颁发。
稽察房，雍正五年（公元1727年），令各部院衙门将每日事件已结、未结情由声明送内阁，于月底汇齐奏报，这时始设稽察房①。其职官由大学士于满、汉侍读、中书内派委，无定员。额设供事 4人，凡交部议复事件，按日记档，俟各部院移会到时，逐一核对，分别已结、未结，每月汇奏一次，叫“月折”。每日军机处发出满、汉文谕旨，由满票签处移至稽察房存储，至月底，缮写满汉文合璧奏折汇奏，称为“汇奏谕旨”。
收发红本处，又称红本处、收本房。康熙、雍正、乾隆三朝《会典》均未见记载。《嘉庆会典》始有此名称。约成立于乾嘉年间。司员由大学士于满、汉中书内派委，无定员。凡批过的题本，交由红本处每日发给六科传钞，年终缴回汇集，贮入红本库。
饭银库，又称饭银处，其司员由大学士于满洲侍读、典籍、中书内派委，无定员。专掌收支内阁司员饭银。这种饭银由各省总督、巡抚及布政使咨送。分配办法是：大学士每日银三钱，以下官员递减，至中书每日银六分，以充飧食费用②。
副本库，约成立于乾嘉年间，《嘉庆会典》始有此名。其司员由大学士于满、汉中书内派委，无定员，掌收题本之副本。乾隆以前，每到年终收藏副本，都派汉票签处的中书送存皇史宬厢房，年久贮满，无地存收，才另设副本库。
批本处，乾隆以前称“红本房”，设于宫廷之内。其司员有满洲翰林院官 1人（于翰林各职事内选用），中书 7人，掌进本之收发与批本事务。每日进本，由满票签处中书送交批本处，由批本处送内奏事处进呈，待发下以后，批本处照皇帝阅定满文签，用红笔批于本面，再交满票签处中书带回内阁，遇有改签及“折本”，皆存记档案，按日交发办理。
清内阁自天聪十年（公元1636年）设内三院起，至宣统三年（公元1911年）止，掌握国政有270 多年之久，但其势力不是始终如一的，是屡有演变的。初设内三院时，尚在关外，并有议政处分其权。那时只是初具规模。入关后，为加重内三院之职权，明命条陈政事或外国（对外）机密或奇特谋略，都由内三院转奏。并定内三院品级与六部同（先是低六部一级）。顺治十五年（公元1658年），正式改为内阁，只是沿袭明代官制，并不是加强内阁职权，相反却降低大学士的品级（正五品），减少了它的职官人数，其权势反而低于内三院。顺治十八年（公元1661年）再改回内三院，大学士品级又同于六部。康熙九年（公元1670年）恢复内阁，大学士兼尚书。康熙亲政后，军国机要，始终归内阁。至雍正八年（公元1730年），大学士升为正一品，在各部尚书之上（尚书为从一品），当时虽已设军机处，但任军机大臣者，除亲王外，其首领必是大学士，所以当时的大学士是勋高位极，因称内阁为“宰辅”。至乾隆二年（公元1737年），再设军机处后（军机处停设了二年），机要章奏都下到军机处。凡军国要务，都要由军机大臣承旨出政，内阁之权便轻，只是办理一些例行事务。赵翼在《檐曝杂记》中说：“军机处，地近宫廷，便于宣召。为军机大臣者，皆亲臣重臣，于是承旨出政，皆在于此矣。”《清史稿·大学士年表序》说：“雍正以后，承旨寄信有军机处。内阁宰辅，名存而已。”原来具有宰相身分的内阁大学士，成为进爵的虚衔，内阁便沦为办理例行政务、颁发文告的机关。光绪二十七年（公元1901年）八月改题为奏，内外臣工的奏章，一般都采用奏折。改题为奏后，各省督抚就不须把题奏事件的副本交通政司转送内阁了，内阁便成了“闲曹”。这时的内阁公署，仅成了储存档案之所。宣统三年（公元1911年）四月，另组西欧式的责任内阁，旧内阁废。
二、军机处
清初沿明旧制，“章疏票拟，主之内阁。军国机要，主之议政处”①。到雍正七年（公元1729年）因西北用兵，往返军报频繁，内阁距内廷太远，皇帝不便亲授机宜，故在这年元月，在内廷设立军机处，其全称为“办理军机事务处”。初设时名为“军机房”，雍正十年（公元1732年）改名办理军机处。
军机处是分割内阁之权，所以说它是“内阁之分局”。军机处在清代统治了180 余年，成为大政所出的宰辅之区。它的体制特殊，职官简炼，有官而无吏。它的全部工作，由军机大臣主持，军机章京办理。
军机大臣俗称“大军机”，分设满、汉员，由满、汉大学士、各部尚书、侍郎、总督等奉特旨应召入值，为兼差，人员无定额；由亲王或大学士满、汉各一员为首领，当时称为“揆首”、“领袖”。依清制，亲王不能入军机。嘉庆四年一月，曾以军机处事繁，命成亲王永瑆在军机处行走。同年十月，又以“非祖制”罢值。至咸丰三年（公元1853年）以后，始有亲王任军机大臣。初期，凡应皇帝召见商议政务，或依皇帝旨意起草诏谕等，均为领班军机大臣之责。凡经皇帝选调到军机处工作的军机大臣，则称为“军机处行走”或“军机大臣上行走”。初入值军机处者，若因其资历或能力尚浅，则命在“军机大臣上学习行走”，即是见习之意，其地位稍低，排班时列于后。一、二年后，再由领班军机大臣专折奏请皇帝，除去“学习”二字。各军机大臣之间，也有资格、品位高低之分，权力各不相同。例如有的满洲大臣只准阅看满文奏折，或新任大臣不准阅看皇帝朱批的奏折。这些不同待遇都是由皇帝亲定。
据《光绪会典》卷1017记载，嘉庆五年（公元1800年）规定：军机大臣只准在军机处承写当日所奉上谕，部院稿案不准在军机处办理（因军机大臣为兼职，仍保留部院原职实缺）。各部司员不准至军机处“回事”（找他们本衙门堂官请示事务）。军机章京办事之处，不准闲人窥视。自王以下满、汉文武大臣，都不准到军机处找军机大臣谈话，“违者重处不赦”。为了严格执行这些规定，每天派都察院御史一人到军机处旁边的内务府值房监视，军机大臣散值后，才准他们退值。
军机处初设时，所掌仅限军务。《清史稿·军机大臣年表序》说：“初只承庙谟商戎略而已。”但以后事权逐渐扩大，以至军国大计莫不总揽。其具体职掌有如下几方面：
一、负责皇帝下达谕旨的撰拟和参预官员上报之奏折文书的处理。官员上报的文书，凡折奏“请旨”者归军机处，照例的题本归内阁，直到清末未变。
二、办理皇帝交议的大政，凡遇重要政事，皇帝不能裁决的，或交军机处议奏，或密议，或交军机处会同关系衙门议奏。特交的，由军机处查议其可否，密拟办法上奏；会同议奏的，或由军机处主稿，或由所会衙门主稿，临时酌定。
三、某些重大案件，皇帝特交军机大臣审理拟定，或由军机大臣会同三法司审拟。军机大臣可在军机处提讯，也可使用刑讯。应刑讯时，选用内务府公所或于步军统领衙门进行。凡秋审案件，军机大臣也参预。
四、重要文武官员之任免及各部尚书、侍郎、各省总督、巡抚、以至道、府、学政、关差、盐政以及驻防将军、都统、驻各边疆地区之领队大臣、办事大臣等官员的补放，均由军机大臣负责开列应补人员名单，交皇帝选择任用。遇科考，也由军机大臣开列主考、总裁名单，奏请皇帝选用。复试或殿试，军机大臣负责核对试卷、检查笔迹或任命阅卷官。
五、考查行军之山川、道里与兵马钱粮：凡有行军，军机处根据有关图书，考查山川险要，道里远近，如系边远地区，图书中没有记载的，要考查新旧档案并加谘访。应用的兵马、钱粮，则由户部、兵部、理藩院等衙门取简明确数备查。遇有皇帝查讯的问题，即时呈递。
六、军机大臣可奉皇帝旨意，以“钦差”身分，往各地检查或处理一些政事。
军机章京，俗称“小军机”，早期也称为“司员”。最初，章京无一定额数，在内阁中书等官员中选调。乾隆初，改由内阁、各部、理藩院等衙门调派。自嘉庆四年（公元1799年）始，定军机章京分满、汉各两班，每班 8人，共32人。各班设领班、帮领班章京各 1员，由军机大臣于章京中选资深望重者任之。军机章京的选任，据《枢恒纪略》卷7 载：“汉军机章京由内阁中书、六部郎中、员外郎、主事、七品小京官由进士、举人出身者兼充；满军机章京以内阁中书、六部、理藩院郎中、员外郎、主事、笔帖式兼充”。光绪三十二年（公元1906年）确定汉章京额缺为20人。
军机章京也是兼差，凡承旨入值军机处的官员，仍为原衙门的实缺并照例升转。军机章京一般为五、六品，领班章京为从三品或正四品。军机章京按例不参加京察，其奖叙升转由军机大臣酌情保奏，平时每届三年奏保，凡遇修补档案，编修方略等事结束时，均照例特保，故章京的提升较快，当时人视之为升官的捷径。光绪三十二年（公元1906年）十二月初十日奏定变通军机章京升补章程，定军机章京为实缺，其领班章京秩视三品，帮领班章京秩视四品，以下各章京俱按原品实授。并规定了三年递升一级的升补办法①。军机章京办理军机处的日常工作，处理文书，记注档册，撰拟文稿等。自乾隆时傅恒任领班军机大臣始，军机章京亦同时负撰拟谕旨之责；还参预军机处新承办案件之审理；跟随军机大臣或单独奉派往各省查办和处理政务。
军机处设于禁廷隆宗门内靠北、乾清门外西侧，军机大臣办公处名为军机堂。军机处内部组织，不见记载。从军机处档案的《交片档》看，有满、汉军机处之分，或简称“满屋”、“汉屋”，由满、汉章京分别任事。又《行文档》中有“清档案处”、“汉档案处”之设，或称“清档房”、“汉档房”，这是管理满、汉档案的分工。在宫廷之内，满屋的办公处设在隆宗门内之南，在军机堂对面之左，右为汉屋。其职掌据《光绪会典》卷3所载，满屋分管在京旗营及各省驻防和西北两路军营官员的补放事务，负责内、外蒙古、藩部及喇嘛等朝贡时拟赏单，并掌管军机处本身的一切事务性工作；汉屋办理在京部院及各省文职官员、绿营武职官员的补放进单，王公内外大臣赏单及拟给外国朝贡使臣赏单，办理皇帝交下的应当查考和应当办理的一切事情，以及负责军机处的对外联系，管理军机处的档案等工作。
军机处的设立，是清王朝对中央行政机构的一次重大变革，表现出清代前期政治制度高度集权的趋向。军机处成立以后，逐渐代替了清建国以来所依靠的满洲亲王，贝勒参预议政的制度，废除了议政处；同时也削弱了内阁参预国政的权力。军机处以“君权附庸”的地位，成为凌驾于内阁及各部、院之上的全国政务的总汇机关，军国大计，无不总揽。
三、通政使司
通政使司是沿袭明制。清入关后，于顺治元年（公元1644年）设立的。名为“通政”，是以政务比水，欲其上下常通之意。据《清朝文献通考》卷82载，通政司“掌受内外章疏，臣民密封申诉之事，凡在外之题本、奏本，在京之奏本，并受而进之于朝，核其不如式及程途稽限者。凡大政大狱，咸得偕部院予议焉。”其具体任务是，收各省题本，校阅后送内阁；查有题本不合规制的，送内阁参处；有逾限期的，移交关系衙门议办。各省将军、副都统与总督、巡抚、提督、总兵等官，按季将奏过本章造具印册，咨送内阁查核。
光绪二十四年（公元1898年）七月，通政使因“事务甚简，半属有名无实”，而被并入内阁。不久，旋于八月十一日又下谕恢复。至光绪二十八年（公元1902年），因改题为奏，职无专司，才被正式裁撤。
通政使司设通政使 2人（满、汉各 1人，正三品），副使 2人（满、汉各 1人，正四品），参议 2人（满、汉各 1人，正五品），经历 2人（满、汉各 1人，正七品），知事 2人（满、汉各 1人，正七品），笔帖式 8人（满 6人，汉 2人），经承15人。分设启奏科、稿房、吏房、礼房、上房、火房等单位。
通政司所属机构有“登闻鼓厅”，管军民击鼓伸冤之事，由参议 1人兼管，由知事率役巡查，并有笔帖式满洲 1人，汉军 1人，经承 6人，分设吏、户、礼、兵、刑、工六房，分别办理所属事务。如有击鼓之人，由通政使讯供，确有冤枉，奏报皇帝交刑部审办。如系诬告，即送刑部按律加一等治罪①。“登闻鼓”，顺治元年（公元1644年）设于都察院，由御史一人监管。顺治十三年（公元1656年）移置长安右门外，以给事中或御史 1人更替管理。到康熙六十一年（公元1722年）才并入通政使司。这是统治者表示为人民“雪冤”的设施。
